Polres Wakatobi membawahi 7 (tujuh) Polsek yang mengamankan 8 (delapan) Kecamatan. Pembagian wilayah hukumnya adalah sebagai berikut:

1. POLSEK WANGI-WANGI

Wilayah Hukum: Kecamatan Wangi-Wangi
Lingkup:

• Pusat pemerintahan Kabupaten Wakatobi
• Daerah perkotaan
• Kawasan perkantoran, pasar, pelabuhan, sekolah, rumah sakit
• Lingkungan pemukiman padat penduduk

2. POLSEK WANGI-WANGI SELATAN (WANGSEL)

Wilayah Hukum: Kecamatan Wangi-Wangi Selatan
Lingkup:

• Wilayah pesisir
• Desa wisata
• Pusat aktivitas ekonomi menengah
• Pelabuhan rakyat & jalur penyeberangan lokal

3. POLSEK KALEDUPA

Wilayah Hukum: Kecamatan Kaledupa
Lingkup:

• Pemukiman penduduk
• Daerah tradisional dan adat
• Pusat kegiatan nelayan
• Kawasan wisata budaya

4. POLSEK KALEDUPA SELATAN (KALSEL)

Wilayah Hukum: Kecamatan Kaledupa Selatan
Lingkup:

• Desa-desa pesisir
• Kawasan mangrove
• Sektor perikanan dan pelayaran kecil
• Wilayah masyarakat adat lokal

5. POLSEK TOMIA

Wilayah Hukum: Kecamatan Tomia
Lingkup:

• Pusat perdagangan
• Kawasan wisata internasional (Wakatobi Diving Spot)
• Pemukiman padat
• Area fasilitas umum dan pemerintahan tingkat kecamatan

6. POLSEK TOMIA TIMUR (TOMTIM)

Wilayah Hukum: Kecamatan Tomia Timur
Lingkup:

• Desa-desa pesisir timur
• Jalur laut wisata dan pelayaran lokal
• Kawasan resort dan homestay wisata
• Pelabuhan tradisional

7. POLSEK BINONGKO

Wilayah Hukum:

• Kecamatan Binongko
• Kecamatan Togo Binongko

Lingkup:

• Dua kecamatan di satu pulau (satu Polsek untuk dua wilayah)
• Daerah terkenal industri tradisional pandai besi
• Wilayah pesisir dan tebing karang
• Aktivitas perikanan & budaya lokal

RINGKASAN STRUKTUR POLSEK vs KECAMATAN

Total Polsek: 7
Total Kecamatan: 8